Margaret syntyi vuonna 1046 ja kuului muinaiseen englantilaiseen kuninkaalliseen sukuun. Hän oli kuningas Alfredin suora jälkeläinen ja Englannin kuningas Edmund Ironsiden pojan Edwardin kautta tämän pojantytär.

Margaret oli perheensä kanssa karkotettu itäiselle mantereelle, kun kuningas Canute ja hänen tanskalainen armeijansa olivat valloittaneet Englannin. Kaunis ja hurskas Margaret oli myös älykäs ja sai virallisen koulutuksen Unkarissa.

Margaret perheineen palasi Englantiin isosetänsä Edvard Tunnustajan valtakauden loppupuolella, sillä hänen nuoremmalla veljellään Edgar Aethelingillä oli vahva oikeus Englannin valtaistuimelle. Englannin aatelisto oli kuitenkin toista mieltä ja valitsi Harold Godwinin Edvardin seuraajaksi.

Kaikki tämä poliittinen manööveri osoittautui merkityksettömäksi, kun Normandian herttua William, joka tunnetaan myös nimellä "Valloittaja", saapui armeijansa kanssa Hastingsin lähelle vuonna 1066, mutta se on toinen tarina.

Margaretin ja hänen perheensä asema oli epävarma, ja he pakenivat henkensä edestä peläten pohjoiseen päinvastaiseen suuntaan kuin etenevät normannit. He olivat matkalla Northumbriasta takaisin mantereelle, kun heidän laivansa ajautui pois kurssilta ja laskeutui Fifeen.

Skotlannin kuningas Malcolm III, joka tunnettiin nimellä Malcolm Canmore (tai Suuri Pää), tarjosi suojelua kuningasperheelle.

Malcolm oli erityisen suojeleva Margaretiin nähden! Margaret kieltäytyi aluksi hänen avioehdotuksistaan, koska erään kertomuksen mukaan hän halusi mieluummin elää hurskaasti neitsyenä. Malcolm oli kuitenkin sinnikäs kuningas, ja pari meni lopulta naimisiin Dunfermlinessä vuonna 1069.

Heidän liittonsa oli poikkeuksellisen onnellinen ja hedelmällinen sekä heille itselleen että Skotlannin kansalle. Margaret toi mukanaan Skotlannin hoviin joitakin Euroopan nykyisten tapojen, seremonioiden ja kulttuurin hienouksia, mikä paransi suuresti sen sivistynyttä mainetta.

Kuningatar Margaret oli tunnettu hyvästä vaikutuksestaan mieheensä ja myös hurskaasta hurskaudestaan ja uskonnollisesta noudattamisestaan. Hän oli Skotlannin kirkon uudistuksen kantava voima.

Kuningatar Margaretin johdolla kirkolliskokoukset edistivät pääsiäisyön ehtoollisyhteyttä ja, työväenluokan suureksi iloksi, pidättäytymistä palvelustyöstä sunnuntaina. Margaret perusti kirkkoja, luostareita ja pyhiinvaellusmajoituksia ja perusti Canterburyn munkkien kanssa Dunfermlinen luostariin kuninkaallisen mausoleumin. Hän piti erityisesti skotlantilaisista pyhimyksistä, ja hän käynnisti kuningattaren lauttaliikenteen Forthin yli, jotenjotta pyhiinvaeltajat pääsisivät helpommin Pyhän Andreaksen pyhäkköön.

Messu vaihdettiin Skotlannissa puhutusta gaelin kielestä yhdistävään latinaan. Ottamalla käyttöön latinan messun viettämisessä hän uskoi, että kaikki skotit voisivat palvoa yhdessä ja yhtenäisesti yhdessä muiden Länsi-Euroopan kristittyjen kanssa. Monet uskovat, että kuningatar Margaretin tavoitteena ei ollut ainoastaan skottien yhdistäminen, vaan myös Skotlannin ja Englannin kansakuntien yhdistäminen.pyrkimyksenä lopettaa verinen sota näiden kahden maan välillä.

Asettaessaan Skotlannin kirkon asialistan kuningatar Margaret varmisti myös roomalaisen kirkon ylivallan maan pohjoisosan alkuperäiseen kelttiläiseen kirkkoon nähden.

Margaret ja Malcolm saivat kahdeksan lasta, joilla kaikilla oli englantilaiset nimet. Alexander ja David seurasivat isäänsä valtaistuimelle, kun taas heidän tyttärensä Edith (joka avioiduttuaan muutti nimensä Matildaksi) toi muinaisen anglosaksisen ja skotlantilaisen kuninkaallisen verenperimän Englannin normanninvalloittajien suoniin mennessään naimisiin ja synnyttäessään lapsia kuningas Henrik I:lle.

Margaret oli hyvin hurskas ja huolehti erityisesti köyhistä ja orvoista. Juuri tämä hurskaus aiheutti huomattavaa vahinkoa hänen terveydelleen toistuvan paaston ja pidättäytymisen vuoksi. Vuonna 1093, kun hän makasi kuolinvuoteellaan pitkän sairauden jälkeen, hänelle kerrottiin, että hänen miehensä ja vanhin poikansa oli väijytetty ja petollisesti tapettu Alnwickin taistelussa Northumbian osavaltiossa. Hän kuoli pian sen jälkeen vain muutaman vuoden ikäisenä.neljäkymmentäseitsemän.

Hänet haudattiin Malcolmin rinnalle Dunfermlinen luostariin, ja hänen haudallaan ja sen ympäristössä tapahtuneiden ihmeiden perusteella paavi Innocentus IV kanonisoi hänet vuonna 1250.

Uskonpuhdistuksen aikana Pyhän Margitin pää siirtyi jotenkin Maria Skotlannin kuningattaren haltuun, ja myöhemmin jesuiitat saivat sen haltuunsa Douaissa, jossa sen uskotaan kadonneen Ranskan vallankumouksen aikana.

Roomalaiskatolinen kirkko vietti aiemmin Pyhän Margaretan juhlaa 10. kesäkuuta, mutta nykyään sitä vietetään joka vuosi hänen kuolemansa vuosipäivänä, 16. marraskuuta.