Margaret s-a născut în 1046 și a fost membră a unei vechi familii regale engleze, fiind descendentă directă a regelui Alfred și nepoata regelui Edmund Ironside al Angliei prin fiul său Edward.

Împreună cu familia ei, Margareta a fost exilată pe continentul estic atunci când regele Canute și armata sa daneză au invadat Anglia. Frumoasă și devotată, Margaret a fost și inteligentă, primind o educație formală în Ungaria.

Margareta și familia ei s-au întors în Anglia spre sfârșitul domniei unchiului ei, Eduard Mărturisitorul, deoarece fratele ei mai mic, Edgar Aetheling, avea o pretenție foarte puternică la tronul englez. Nobilimea engleză avea însă alte idei și l-a ales pe Harold Godwin ca succesor al lui Eduard.

Toate aceste manevre politice s-au dovedit a fi irelevante atunci când William, Duce de Normandia, cunoscut și sub numele de "Cuceritorul", a sosit cu armata sa lângă Hastings în 1066, dar aceasta este o altă poveste.

Fiind unii dintre ultimii regali sași rămași în Anglia, Margaret și familia ei se aflau într-o poziție precară și, temându-se pentru viețile lor, au fugit spre nord, în direcția opusă avansării normanzilor. Se îndreptau spre continent din Northumbria când nava lor a fost scoasă din curs și a aterizat în Fife.

Regele scoțian Malcolm al III-lea, cunoscut sub numele de Malcolm Canmore (sau Marele Cap), și-a oferit protecția familiei regale.

Malcolm a fost deosebit de protector față de Margareta! Inițial, aceasta a refuzat propunerile sale de căsătorie, preferând, potrivit unei relatări, o viață de evlavie ca fecioară. Malcolm a fost însă un rege perseverent, iar cuplul s-a căsătorit în cele din urmă la Dunfermline în 1069.

Unirea lor a fost extrem de fericită și fructuoasă atât pentru ei înșiși, cât și pentru națiunea scoțiană. Margareta a adus cu ea la curtea scoțiană unele dintre cele mai fine aspecte ale manierelor, ceremoniilor și culturii europene actuale, ceea ce a îmbunătățit considerabil reputația civilizată a acesteia.

Regina Margareta a fost renumită pentru influența sa bună asupra soțului său, dar și pentru evlavia și respectarea religioasă. A fost un factor important în reforma Bisericii din Scoția.

Sub conducerea reginei Margareta, consiliile bisericești au promovat împărtășania de Paști și, spre bucuria clasei muncitoare, abstinența de la munca servilă în zilele de duminică. Margareta a fondat biserici, mănăstiri și centre de pelerinaj și a înființat Mausoleul Regal de la Abația Dunfermline cu călugări din Canterbury. Ea a fost deosebit de atașată de sfinții scoțieni și a inițiat Feribotul Reginei peste Forth, astfel căpentru ca pelerinii să poată ajunge mai ușor la sanctuarul Sfântului Andrei.

Prin adoptarea latinei pentru celebrarea Sfintei Liturghii, regina Margareta a crezut că toți scoțienii se vor putea închina împreună, în unitate, alături de ceilalți creștini din Europa de Vest. Mulți oameni cred că, prin acest lucru, regina Margareta nu a urmărit doar unirea scoțienilor, ci și a celor două națiuni, Scoția și Anglia.în încercarea de a pune capăt războiului sângeros dintre cele două țări.

Stabilind agenda bisericii din Scoția, regina Margareta a asigurat, de asemenea, dominația Bisericii Romane asupra Bisericii Celtice din nordul țării.

Margaret și Malcolm au avut opt copii, toți cu nume englezești. Alexander și David și-au urmat tatăl la tron, în timp ce fiica lor, Edith (care și-a schimbat numele în Matilda la căsătorie), a adus străvechea linie de sânge regală anglo-saxonă și scoțiană în venele invadatorilor normanzi din Anglia când s-a căsătorit și a dat naștere la copii regelui Henric I.

Margareta era foarte pioasă și se îngrijea în special de săraci și de orfani. Tocmai această pietate i-a afectat considerabil sănătatea, din cauza posturilor repetate și a abstinenței. În 1093, pe când se afla pe patul de moarte după o boală îndelungată, a fost anunțată că soțul și fiul ei cel mare au căzut într-o ambuscadă și au fost uciși în mod perfid în bătălia de la Alnwick, în Northumbia. A murit la scurt timp după aceea, la vârsta de numaipatruzeci și șapte.

A fost înmormântată alături de Malcolm în Dunfermline Abbey, iar miracolele raportate care au avut loc în mormântul ei și în jurul acestuia au sprijinit canonizarea ei în 1250 de către Papa Inocențiu al IV-lea.

În timpul Reformei, capul Sfintei Margareta a ajuns cumva în posesia Mariei, regina Scoției, iar mai târziu a fost pus în siguranță de iezuiți la Douai, unde se crede că a pierit în timpul Revoluției Franceze.

Sărbătoarea Sfintei Margareta a fost celebrată anterior de Biserica Romano-Catolică la 10 iunie, dar acum este sărbătorită în fiecare an la aniversarea morții sale, la 16 noiembrie.