Margaret je rođena 1046. godine i bila je članica drevne engleske kraljevske porodice. Bila je direktni potomak kralja Alfreda i bila je unuka engleskog kralja Edmunda Ironsidea preko njegovog sina Edwarda.

Zajedno sa svojom porodicom Margaret je bila prognana na istočni kontinent kada su kralj Canute i njegova danska vojska pregazili Engleska. Lijepa i pobožna, bila je i inteligentna dok je formalno obrazovanje stekla u Mađarskoj.

Margaret i njena porodica vratili su se u Englesku pred kraj vladavine njenog pra-strica, Edvarda Ispovjednika, kao njen mlađi brat Edgar the Aetheling, imao je veoma jake pretenzije na engleski tron. Englesko plemstvo je ipak imalo druge ideje i izabralo je Harolda Godwina za Edwardovog nasljednika.

Sva ova politička manevriranja pokazala se irelevantnom kada je Vilijam, vojvoda od Normandije, inače poznat kao 'Osvajač', stigao sa svojom vojskom blizu Hastingsa 1066. , ali to je druga priča.

Kao neki od posljednjih preostalih Saxon Royals-a u Engleskoj, položaj Margaret i njene porodice bio je nesiguran i u strahu za svoje živote pobjegli su na sjever, u suprotnom smjeru od Normana koji su napredovali. Vraćali su se na kontinent iz Northumbrije kada je njihov brod skrenuo s kursa i pristao u Fife.

Škotski kralj Malcolm III, poznat kao Malcolm Canmore (ili Velika glava) ponudio je svoju zaštitu kraljevskoj porodici .

Malcolm je bioposebno zaštitnički prema Margaret! U početku je odbijala njegove ponude za brak, preferirajući, prema jednom izvještaju, život pobožnosti kao djevica. Malcolm je, međutim, bio uporan kralj, i par se konačno vjenčao u Dunfermlineu 1069.

Njihova zajednica bila je izuzetno sretna i plodna i za njih i za škotsku naciju. Margaret je sa sobom ponijela neke od finijih tačaka sadašnjih evropskih manira, ceremonija i kulture na škotski dvor, što je uvelike poboljšalo njegovu civiliziranu reputaciju.

Kraljica Margaret bila je poznata po svom dobrom utjecaju na svog muža, ali i po njoj pobožnosti i vjerskih obreda. Bila je glavni pokretač reforme Crkve u Škotskoj.

Pod vodstvom kraljice Margarete crkveni savjeti promovirali su uskršnje zajedništvo i, na veliku radost radničke klase, uzdržavanje od ropskog rada nedjeljom. Margaret je osnovala crkve, manastire i hodočasničke hostele i osnovala Kraljevski mauzolej u opatiji Dunfermline sa monasima iz Canterburyja. Posebno je voljela škotske svece i pokrenula je Kraljičin trajekt preko Fortha kako bi hodočasnici mogli lakše doći do svetišta Svetog Andrije.

Misa je promijenjena s mnogih dijalekata galskog jezika koji se govore širom Škotske u ujedinjujuću Latinski. Usvojivši latinski za slavlje mise, vjerovala je da svi Škoti mogu zajedno bogoslužiti u jedinstvu, zajedno sadrugih hrišćana zapadne Evrope. Mnogi ljudi vjeruju da čineći ovo, nije bio samo cilj kraljice Margaret da ujedini Škote, već i dva naroda Škotske i Engleske u pokušaju da se okonča krvavi rat između dvije zemlje.

U postavu program za crkvu u Škotskoj Kraljica Margaret je također osigurala dominaciju Rimske crkve nad domaćom keltskom crkvom na sjeveru zemlje.

Margaret i Malcolm su imali osmoro djece, sva s engleskim imenima. Aleksandar i David su slijedili svog oca do prijestolja, dok je njihova kćerka Edith (koja je promijenila ime u Matilda nakon udaje) donijela drevnu anglosaksonsku i škotsku kraljevsku krvnu lozu u vene normanskih osvajača Engleske kada se udala i rodila djecu kralju Henriku I.

Margareta je bila vrlo pobožna i brinula se posebno o siromašnima i siročadi. Upravo je ta pobožnost nanijela znatnu štetu njenom zdravlju ponovnim postom i uzdržavanjem. Godine 1093., dok je ležala na samrti nakon duge bolesti, rečeno joj je da su njen muž i najstariji sin upali u zasjedu i izdajničko ubijeni u bici kod Alnwicka u Northumbiji. Umrla je ubrzo nakon što je imala samo četrdeset sedme godine.

Pokopana je zajedno s Malcolmom u opatiji Dunfermline i prijavljena čuda koja su se dogodila ui oko njene grobnice podržala su njenu kanonizaciju 1250. godine od strane pape Inocentija.IV.

Tokom reformacije glava svete Margarete je nekako prešla u posjed Marije kraljice Škotske, a kasnije su je osigurali jezuiti u Douaiu, gdje se vjeruje da je nestala za vrijeme Francuske revolucije.

Praznik Svete Margarete je ranije obilježavala Rimokatolička crkva 10. juna, ali se sada slavi svake godine na godišnjicu njene smrti, 16. novembra.