Die 1046 geborene Margarete stammte aus einer alten englischen Königsfamilie, war eine direkte Nachfahrin von König Alfred und über dessen Sohn Edward die Enkelin von König Edmund Ironside von England.

Margaret war mit ihrer Familie auf den östlichen Kontinent verbannt worden, als König Canute und seine dänische Armee England überrannt hatten. Sie war schön und fromm, aber auch intelligent und erhielt ihre formale Ausbildung in Ungarn.

Margarete und ihre Familie kehrten gegen Ende der Regierungszeit ihres Großonkels, Eduard des Bekenners, nach England zurück, da ihr jüngerer Bruder, Edgar der Äthling, einen starken Anspruch auf den englischen Thron erhob. Der englische Adel hatte jedoch andere Vorstellungen und wählte Harold Godwin zu Edwards Nachfolger.

All diese politischen Manöver erwiesen sich als irrelevant, als Wilhelm, Herzog der Normandie, auch bekannt als "der Eroberer", 1066 mit seiner Armee in der Nähe von Hastings eintraf, aber das ist eine andere Geschichte.

Als einige der letzten verbliebenen sächsischen Könige in England war die Lage von Margaret und ihrer Familie prekär, und aus Angst um ihr Leben flohen sie nach Norden, in die entgegengesetzte Richtung zu den vorrückenden Normannen. Sie waren auf dem Rückweg von Northumbria zum Kontinent, als ihr Schiff vom Kurs abkam und in Fife landete.

Der schottische König Malcolm III, bekannt als Malcolm Canmore (oder Great Head), bot der königlichen Familie seinen Schutz an.

Malcolm kümmerte sich besonders um Margarete, die seine Heiratsanträge zunächst ablehnte und einer Erzählung zufolge ein frommes Leben als Jungfrau vorzog. Malcolm war jedoch ein hartnäckiger König, und das Paar heiratete schließlich 1069 in Dunfermline.

Ihre Verbindung war sowohl für sie selbst als auch für die schottische Nation außerordentlich glücklich und fruchtbar. Margaret brachte einige der Feinheiten der aktuellen europäischen Sitten, Zeremonien und Kultur an den schottischen Hof, was dessen zivilisierten Ruf erheblich verbesserte.

Königin Margaret war bekannt für ihren guten Einfluss auf ihren Ehemann sowie für ihre Frömmigkeit und religiöse Observanz. Sie war eine der treibenden Kräfte bei der Reform der Kirche in Schottland.

Unter der Führung von Königin Margaret förderten Kirchenräte das Ostergottesdienst und - sehr zur Freude der Arbeiterschaft - die Abstinenz von der Sonntagsarbeit. Margaret gründete Kirchen, Klöster und Pilgerherbergen und errichtete mit Mönchen aus Canterbury das königliche Mausoleum in der Abtei von Dunfermline. Sie hatte eine besondere Vorliebe für schottische Heilige und veranlasste die Queen's Ferry über den Forth, damitdamit die Pilger das Heiligtum des Heiligen Andreas leichter erreichen können.

Die Messe wurde von den vielen gälischen Dialekten, die in Schottland gesprochen wurden, auf das vereinheitlichende Latein umgestellt. Durch die Einführung der lateinischen Sprache für die Feier der Messe glaubte sie, dass alle Schotten zusammen mit den anderen Christen Westeuropas gemeinsam Gottesdienst feiern könnten. Viele glauben, dass Königin Margaret damit nicht nur das Ziel verfolgte, die Schotten zu vereinen, sondern auch die beiden Nationen Schottland und Englandin dem Versuch, den blutigen Krieg zwischen den beiden Ländern zu beenden.

Durch die Festlegung der kirchlichen Tagesordnung in Schottland sicherte Königin Margaret auch die Vorherrschaft der römischen Kirche über die einheimische keltische Kirche im Norden des Landes.

Margaret und Malcolm hatten acht Kinder, die alle englische Namen trugen: Alexander und David folgten ihrem Vater auf den Thron, während ihre Tochter Edith (die bei ihrer Heirat ihren Namen in Matilda änderte) die alte angelsächsische und schottische königliche Blutlinie in die Adern der normannischen Invasoren Englands brachte, als sie König Heinrich I. heiratete und ihm Kinder gebar.

Margarete war sehr fromm und kümmerte sich besonders um die Armen und Waisen. Diese Frömmigkeit führte dazu, dass ihre Gesundheit durch das wiederholte Fasten und die Enthaltsamkeit erheblich geschädigt wurde. 1093, als sie nach langer Krankheit auf dem Sterbebett lag, erfuhr sie, dass ihr Mann und ihr ältester Sohn in der Schlacht von Alnwick in Northumbia in einen Hinterhalt geraten und heimtückisch getötet worden waren. Sie starb kurz darauf im Alter von nursiebenundvierzig.

Sie wurde neben Malcolm in der Abtei von Dunfermline begraben, und die Wunder, die sich in und um ihr Grab ereignet haben sollen, unterstützten ihre Heiligsprechung durch Papst Innozenz IV. im Jahr 1250.

Während der Reformation gelangte der Kopf der heiligen Margareta irgendwie in den Besitz von Maria, der Königin der Schotten, und wurde später von den Jesuiten in Douai sichergestellt, wo er vermutlich während der Französischen Revolution unterging.

Das Fest der heiligen Margareta wurde früher von der römisch-katholischen Kirche am 10. Juni begangen, wird aber jetzt jedes Jahr an ihrem Todestag, dem 16. November, gefeiert.