マーガレットはアルフレッド王の直系の子孫であり、その息子エドワードを通じてイングランド王エドモンド・アイアンサイドの孫娘にあたる。

マーガレットは、カヌート王とそのデンマーク軍がイングランドを制圧したとき、家族とともに東の大陸に追放された。 美しく敬虔な彼女は、ハンガリーで正式な教育を受けた聡明な女性でもあった。

マーガレットとその家族は、大叔父であるエドワード懺悔王の治世の終わりにイングランドに戻った。 彼女の弟であるエドガー・エーテリングがイングランドの王位継承権を強く主張していたからである。 しかし、イングランドの貴族たちは別の考えを持っており、ハロルド・ゴドウィンをエドワードの後継者として選出した。

1066年、ノルマンディー公ウィリアム（別名 "征服者"）が軍隊を率いてヘイスティングス近郊に到着したとき、こうした政治的駆け引きはすべて無意味なものとなったが、それはまた別の話である。

イングランドに残された最後のサクソン王家の一人であったマーガレットとその一族の立場は不安定で、命の危険を感じた彼らは、進撃してくるノルマン人とは反対方向に北上して逃亡した。 彼らはノーザンブリアから大陸に戻る途中、船が航路を外れてファイフに上陸した。

マルコム・キャンモア（またはグレート・ヘッド）として知られるスコットランド王マルコム3世は、王家の保護を申し出た。

マルコムは特にマーガレットを溺愛していた！彼女は当初、処女としての敬虔な生活を好み、彼の求婚を断っていた。 しかしマルコムは執拗な王であり、1069年にダンファームリンでようやく結婚した。

マーガレットは、現在のヨーロッパのマナーや儀式、文化をスコットランドの宮廷に持ち込み、その文明的な評判を大いに高めた。

マーガレット王妃は、夫に良い影響を与えただけでなく、敬虔な信心深さと宗教的遵守で有名であった。 彼女はスコットランドの教会改革の立役者であった。

マーガレット王妃の指導の下、教会評議会は復活祭の聖体拝領を推進し、労働者階級が大喜びした日曜の奴隷労働の禁忌を奨励した。 マーガレットは教会、修道院、巡礼ホステルを設立し、カンタベリーから修道士を招いてダンファームリン修道院に王家の霊廟を建立した。 彼女は特にスコットランドの聖人を愛し、フォース川に女王の渡しを設置した。巡礼者たちが聖アンデレ廟により簡単にたどり着けるようにするためである。

ミサは、スコットランド全土で話されていたゲール語の多くの方言から、統一されたラテン語に変更された。 ミサを祝うためにラテン語を採用することで、彼女はすべてのスコットランド人が、西ヨーロッパの他のキリスト教徒とともに、団結して礼拝できると信じていた。 多くの人々は、これを行うことで、スコットランド人だけではなく、スコットランドとイングランドの2つの国を統一することがマーガレット女王の目標であったと信じている。両国間の血なまぐさい戦いに終止符を打つための試みである。

マーガレット女王は、スコットランドの教会の課題を設定することで、同国北部の土着のケルト教会に対するローマ教会の支配を確実なものにした。

マーガレットとマルコムの間には8人の子供が生まれたが、全員がイギリス名であった。 アレキサンダーとデイヴィッドは父に続いて王位につき、娘のイーディス（結婚と同時にマチルダと改名）はヘンリー1世と結婚し子供をもうけたことで、古代のアングロ・サクソンとスコットランドの王家の血統をノルマン人のイングランド侵略者の血脈にもたらした。

マーガレットは非常に敬虔で、特に貧しい人々や孤児に心を配っていた。 その敬虔さゆえに、断食と禁欲を繰り返し、健康をかなり害していた。 1093年、長い闘病生活を終えて死の床にあった彼女は、夫と長男がノーサンビアのアルンウィックの戦いで待ち伏せされ、不当に殺されたことを知らされた。 彼女はその直後に、わずか1歳で亡くなった。47だ。

彼女はマルコムとともにダンファームリン修道院に埋葬され、彼女の墓とその周辺で起こったとされる奇跡は、1250年に教皇イノセント4世によって列聖された。

宗教改革の間、聖マーガレットの頭部はどういうわけかスコットランドのメアリー女王の手に渡り、後にドゥーエのイエズス会によって確保されたが、フランス革命の間に消滅したと考えられている。

聖マーガレットの祝日は、以前はローマ・カトリック教会によって6月10日に祝われていたが、現在は毎年彼女の命日である11月16日に祝われている。