Margareta je rođena 1046. i bila je članica drevne engleske kraljevske obitelji. Bila je izravni potomak kralja Alfreda i bila je unuka engleskog kralja Edmunda Ironsidea preko njegova sina Edwarda.

Zajedno sa svojom obitelji Margaret je bila prognana na istočni kontinent kada su kralj Canute i njegova danska vojska pregazili Engleska. Lijepa i pobožna bila je i inteligentna stekavši svoje formalno obrazovanje u Mađarskoj.

Margareta i njezina obitelj vratili su se u Englesku pred kraj vladavine njezinog praujaka, Edwarda Ispovjednika, kao njezin mlađi brat, Edgar the Aetheling, imao je vrlo jaka prava na englesko prijestolje. Međutim, englesko plemstvo imalo je druge ideje i izabralo je Harolda Godwina za Edwardova nasljednika.

Sva ova politička manevriranja pokazala su se nevažnima kada je William, vojvoda od Normandije, inače poznat kao 'Osvajač', stigao sa svojom vojskom blizu Hastingsa 1066. , ali to je druga priča.

Kao neki od posljednjih preostalih saksonskih kraljeva u Engleskoj, položaj Margarete i njezine obitelji bio je nesiguran i u strahu za svoje živote pobjegli su na sjever, u smjeru suprotnom od napredovanja Normana. Krenuli su natrag na kontinent iz Northumbrije kada je njihov brod skrenuo s kursa i sletio u Fife.

Škotski kralj Malcolm III., poznat kao Malcolm Canmore (ili Velika glava) ponudio je svoju zaštitu kraljevskoj obitelji .

Malcolm je bioosobito zaštitnički prema Margaret! U početku je odbijala njegove prijedloge za brak, preferirajući, prema jednom izvještaju, život pun pobožnosti kao djevica. Malcolm je međutim bio uporan kralj, a par se konačno vjenčao u Dunfermlineu 1069. godine.

Njihova je zajednica bila iznimno sretna i plodna i za njih i za škotski narod. Margareta je sa sobom donijela neke od finijih točaka trenutnih europskih manira, ceremonije i kulture na škotski dvor, što je uvelike poboljšalo njegov civilizirani ugled.

Kraljica Margareta bila je poznata po svom dobrom utjecaju na svog muža, ali i na sebe pobožna pobožnost i vjerski obredi. Bila je glavni pokretač reforme Crkve u Škotskoj.

Pod vodstvom kraljice Margarete crkvena vijeća promicala su uskršnju pričest i, na veliku radost radničke klase, suzdržavanje od ropskog rada nedjeljom. Margareta je osnovala crkve, samostane i hodočasničke domove te uspostavila Kraljevski mauzolej u opatiji Dunfermline s redovnicima iz Canterburyja. Osobito su joj bili dragi škotski sveci i potaknula je Queen's Ferry preko Fortha kako bi hodočasnici mogli lakše doći do svetišta sv. Andrije.

Misa je promijenjena s mnogih dijalekata galskog koji se govori diljem Škotske na objedinjujuću Latinski. Usvajajući latinski za slavljenje mise, vjerovala je da svi Škoti mogu slaviti zajedno u jedinstvu, zajedno sdrugi kršćani zapadne Europe. Mnogi ljudi vjeruju da time nije samo cilj kraljice Margarete bio ujediniti Škote, već i dvije nacije Škotske i Engleske u pokušaju okončanja krvavog rata između dviju zemalja.

U okruženju plan za crkvu u Škotskoj Kraljica Margareta također je osigurala dominaciju Rimske crkve nad izvornom Keltskom crkvom na sjeveru zemlje.

Margaret i Malcolm imali su osmero djece, sva s engleskim imenima. Alexander i David slijedili su svog oca do prijestolja, dok je njihova kći, Edith (koja je nakon udaje promijenila ime u Matilda), unijela drevnu anglosaksonsku i škotsku kraljevsku krvnu lozu u vene normanskih osvajača Engleske kada se udala i rodila djecu kralju Henriku I.

Margareta je bila vrlo pobožna i posebno se brinula za siromašne i siročad. Upravo je ta pobožnost uzrokovala znatnu štetu njezinu zdravlju višekratnim postom i nemrsom. Godine 1093., dok je ležala na samrtnoj postelji nakon duge bolesti, rečeno joj je da su njezin muž i najstariji sin upali u zasjedu i podmuklo ubijeni u bitci kod Alnwicka u Northumbiji. Umrla je nedugo nakon što je imala samo četrdeset sedam godina.

Pokopana je uz Malcolma u opatiji Dunfermline, a zabilježena čuda koja su se događala u njezinoj grobnici i oko nje poduprla su njezinu kanonizaciju 1250. godine od strane pape Inocenta.IV.

Tijekom reformacije glava svete Margarete nekako je prešla u posjed Marije, kraljice Škotske, a kasnije su je osigurali isusovci u Douaiju, gdje se vjeruje da je nestala tijekom Francuske revolucije.

Blagdan svete Margarete prije je Rimokatolička crkva slavila 10. lipnja, ali sada se slavi svake godine na godišnjicu njezine smrti, 16. studenog.