Margaret ble født i 1046 og var medlem av en gammel engelsk kongefamilie. Hun var en direkte etterkommer av kong Alfred og var barnebarnet til kong Edmund Ironside av England gjennom sønnen Edward.

Sammen med familien hadde Margaret blitt forvist til det østlige kontinentet da kong Knud og hans danske hær hadde overkjørt England. Vakker og hengiven var hun også intelligent da hun mottok sin formelle utdannelse i Ungarn.

Margaret og familien hennes vendte tilbake til England mot slutten av hennes oldeonkel, Edvard Bekjenneren, som hennes yngre bror, Edgar. Aetheling, hadde et veldig sterkt krav på den engelske tronen. Den engelske adelen hadde imidlertid andre ideer og valgte Harold Godwin som Edwards etterfølger.

Alle denne politiske manøvreringen viste seg å være irrelevant da William, hertugen av Normandie, ellers kjent som "The Conqueror" ankom med sin hær nær Hastings i 1066 , men det er en annen historie.

Som noen av de siste gjenværende saksiske kongelige i England, var Margaret og hennes families posisjon prekær og fryktet for livet, de flyktet nordover, i motsatt retning av de fremrykkende normannerne. De var på vei tilbake til kontinentet fra Northumbria da skipet deres ble blåst ut av kurs og landet i Fife.

Den skotske kongen, Malcolm III, kjent som Malcolm Canmore (eller Great Head) tilbød sin beskyttelse til kongefamilien .

Malcolm varspesielt beskyttende mot Margaret! Hun avslo først hans forslag om ekteskap, og foretrakk, ifølge en beretning, et liv i fromhet som jomfru. Malcolm var imidlertid en vedvarende konge, og paret giftet seg til slutt i Dunfermline i 1069.

Foreningen deres var usedvanlig lykkelig og fruktbar for både dem selv og den skotske nasjonen. Margaret tok med seg noen av de fineste punktene ved gjeldende europeiske manerer, seremoni og kultur til det skotske domstolen, som i høy grad forbedret dets siviliserte rykte.

Dronning Margaret var kjent for sin gode innflytelse på ektemannen og også for henne hengiven fromhet og religiøs overholdelse. Hun var en pådriver for reformen av kirken i Skottland.

Under dronning Margarets ledelse fremmet Kirkeråd påskens nattverd og, til stor glede for arbeiderklassen, avholdenhet fra tjenestearbeid på en søndag. Margaret grunnla kirker, klostre og pilegrimsvandrerhjem og etablerte Royal Mausoleum ved Dunfermline Abbey med munker fra Canterbury. Hun var spesielt glad i skotske helgener og startet Dronningens ferge over Forth slik at pilegrimer lettere kunne nå helligdommen St. Andrew.

Messen ble endret fra de mange gæliske dialektene som ble snakket over hele Skottland til den samlende latin. Ved å adoptere latin for å feire messen trodde hun at alle skotter kunne tilbe sammen i enhet, sammen medandre kristne i Vest-Europa. Mange tror at ved å gjøre dette, var det ikke bare dronning Margarets mål å forene skottene, men også de to nasjonene Skottland og England i et forsøk på å få slutt på den blodige krigføringen mellom de to landene.

I setting agendaen for kirken i Skottland Dronning Margaret sørget også for romerkirkens dominans over den innfødte keltiske kirken nord i landet.

Margaret og Malcolm hadde åtte barn, alle med engelske navn. Alexander og David fulgte faren til tronen, mens datteren deres, Edith (som skiftet navn til Matilda etter ekteskapet), brakte den eldgamle angelsaksiske og skotske kongelige blodlinjen inn i venene til Norman Invaders of England da hun giftet seg og fødte barn til kong Henrik I.

Margaret var veldig from og brydde seg spesielt om de fattige og foreldreløse. Det var denne fromheten som forårsaket betydelig skade på helsen hennes med den gjentatte fasten og avholdenheten. I 1093, mens hun lå på dødsleiet etter lang tids sykdom, ble hun fortalt at hennes mann og eldste sønn var blitt overfalt og forrædersk drept i slaget ved Alnwick i Northumbia. Hun døde kort tid etter bare førtisyv år gammel.

Hun ble gravlagt sammen med Malcolm i Dunfermline Abbey, og de rapporterte miraklene som fant sted i og rundt graven hennes støttet hennes kanonisering i 1250 av pave InnocentiusIV.

Under reformasjonen gikk St. Margarets hode på en eller annen måte over i Mary Queen of Scots, og ble senere sikret av jesuittene i Douai, hvor det antas å ha omkommet under den franske revolusjonen.

St. Margaret-festen ble tidligere feiret av den romersk-katolske kirke den 10. juni, men feires nå hvert år på årsdagen for hennes død, 16. november.